Из Рима он отправился в Фессалию, где разбил Помпея, и оттуда в Африку. Здесь он разгромил сторонников Помпея, сыновья которого, овладев Балеарскими островами и опираясь на Испанию, где у них было мало приверженцев, продолжали вести борьбу против Цезаря. Цезарь вынужден был вернуться в Испанию и после нескольких стычек с противником, в которых ему оказывали поддержку туземцы, одержал, хотя и дорогой ценой, решительную победу в битве под Мундой (близ Ронды, в предгорьях Сьерры де Голох). В этом сражении, по некоторым сведениям, обе стороны потеряли свыше 30 000 человек. В сущности этой битвой война была завершена. Правда, Цезарь еще некоторое время вел борьбу за овладение Кордовой и другими городами. В одной из битв пал (45 г. до н. э.) старший сын Помпея — Кней. Младший — Секст — бежал на Балеарские острова и оттуда совершал пиратские набеги на берега полуострова. В конце концов он был разбит на море и в 35 г. до н. э. умер в Греции.

Цезарь вплоть до дня гибели (т. е. до 1 5 марта 44 г. до н. э.) был полновластным диктатором. После его убийства был образован триумвират (племянник Цезаря Октавиан, Марк Антоний и Лепид) (43 г. до н э.). Вскоре этот союз распался, и в 30 г. до н. э. верховная власть окончательно была закреплена за Октавианом, принявшим имя Августа. Эта дата отмечает начало эпохи Римской империи.